Vienos Berno gimnazijos mokytojas Raimundas Gregorijus ant tilto sutinka moterį raudonu paltu, kalbančią portugališkai. Nuo to viskas ir prasideda – vyriškis tiesiog per pamokos vidurį išeina iš gimnazijos ir netrukus atsiduria Lisabonoje. Čia jis viliasi rasti netikėtai Berno antikvariate aptiktos portugališkos knygos autorių, gydytoją Amadėją de Pradą. Lisabonoje Raimundas Gregorijus sužino, kad jį sukrėtusio kūrinio autorius miręs daugiau nei prieš trisdešimt metų, bet sutinka jį pažinojusius žmones ir iš jų pasakojimų pamažu sudeda kilmingojo gydytojo portretą.
„Naktinis traukinys į Lisaboną” primena, kad kiekvienas įvykis gali tapti ramaus gyvenimo pabaiga ir vidinių klajonių pradžia…